根据协议，两校将首批在地理信息、数学、新闻传播学、生物学、化学5个双方都具有优势和特色的学科领域联合培养全日制博士研究生和硕博连读研究生。为保证合作培养质量，每个联合培养的学科领域每年招生计划原则上不超过2名。学生由双方组织遴选（硕博连续的硕士研究生须通过全国硕士研究生统一招生考试），培养过程和学位论文由双方导师共同参与完成。联合培养研究生实行双导师制。培养方案和研究课题由双方院系协商制定。
联合培养研究生将实行双校园制，在浸会大学和深大完成不同阶段的课程学习或课题研究任务。联合培养研究生质量标准将与国际接轨。此次联合培养项目旨在培养既熟悉中国国情又具有国际视野的创新型高层次人才，相关专业的课程内容设置、研究方法训练、学位论文评审答辩等均以浸会大学标准规程进行，博士学位论文的撰写、答辩均以英文进行，质量标准完全与国际接轨。
据了解，深大已出台《联合培养博士生管理办法》，通过发放科研津贴、安排住宿等方式，对本校教师与港澳及国外知名高校联合培养研究生给予鼓励和支持。
