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上海生科院等解析钴离子ECF转运蛋白复合体的结构与机理

时间:2017-03-27来源:中国科学院

ABC转运蛋白依靠分解ATP产生的能量驱动信号分子、营养物质、药物分子等的跨细胞膜转运,是生物体中最大的初级主动转运蛋白家族。ECF转运蛋白是近年来发现的一类新型ABC内向转运蛋白,结构上由膜内底物特异结合蛋白EcfS和一个由跨膜蛋白EcfT和两个胞内ATP结合蛋白组成的能量耦合模块(或ECF模块)组成,分为能量耦合模块专用型(Group-I)和共享型(Group-II)两类(图1a)。专用型每个EcfS蛋白使用专一的ECF模块,共享型多个不同的EcfS蛋白共享同一个ECF模块。ECF转运蛋白在细菌与植物中保守存在,介导微量营养物质的跨膜转运。在前期工作中,张鹏课题组解析了多个共享型ECF转运蛋白复合体的结构,阐释了底物识别、模块共享、跨膜转运的分子机制。然而,人们对专用型ECF转运蛋白的结构与机理缺乏了解。

中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究人员选择专用型ECF转运蛋白的典型代表——跨膜转运钴离子的CbiMNQO为研究对象开展结构与机理的研究。CbiMNQO是由膜蛋白CbiMCbiNCbiQ和细胞质内的ATP结合蛋白CbiO组成的五亚基复合体(图1a)。研究人员建立了基于质谱的体内转运活性检测系统,发现CbiMNQOCo2+转运活性需要N蛋白(图1b)。在体外,N蛋白对复合体的ATP水解活性却没有影响,CbiM蛋白对复合体ATP水解活力则具有强的激活效应,且激活不依赖于底物Co2+的存在(图1c)。研究人员解析了CbiMQO复合体2.8分辨率的晶体结构(图1d)。通过将CbiMQO复合体中底物释放状态的CbiM与之前报道的底物结合状态的NikM进行比较,发现连接第2和第3个跨膜螺旋的L1 loop发生了显著的构象变化(图1e),可以作为底物进出CbiM的门控开关。进而,通过解析复合体中CbiO蛋白处于ATP结合状态(关闭构象)的结构,并将之与CbiMQO复合体结构中处于ATP释放状态的CbiO结构(开放构象)进行比较,揭示了转运复合体中CbiO蛋白在ATP结合与释放过程中的构象变化(图1f)。鉴于缺少CbiN不影响复合体的ATP水解活力,但却丧失Co2+转运活性的实验结果,研究人员预测CbiN蛋白在CbiMCbiQ的构象耦联中起重要作用(图1g)。这是首次对专用型ECF转运蛋白复合体结构的报道,对理解不同类型ECF转运蛋白的跨膜转运机理具有重要意义。

上述研究成果于321日在线发表在《细胞研究》(cell research上,中科院上海生科院植生生态所张鹏研究组博士研究生鲍志浩和齐晓峰为该论文的共同第一作者,研究员张鹏和清华大学教授王佳伟为论文的共同通讯作者。研究工作得到了上海生科院植生生态所研究员晁代印研究组和生物化学与细胞生物学研究所研究员李典范研究组的大力帮助。晶体衍射数据收集工作得到了国家蛋白质中心19U1/18U1线站和上海光源17U线站的支持。该项目得到国家科技部、基金委和中科院的经费资助。

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