根据教育部科技发展中心2016年12月发布的《关于公布2015年度“中国科技论文在线优秀期刊”暨“中国科技论文在线科技期刊“优秀组织单位评选结果的通知》(教技发中心函〔2016〕143号)，《西南交通大学学报》荣获2015年度“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖，西南交通大学荣获2015年度“中国科技论文在线科技期刊”优秀组织单位。这是《西南交通大学学报》连续3年蝉联此奖项。

教育部科技发展中心为了促进科技期刊健康发展，提高科技期刊的质量，推动科技期刊的数字化建设，扩大科技期刊的影响力，更好地为科学研究和科技工作者服务，对收录在“中国科技论文在线”的部属期刊各项指标，从期刊的影响因子和他引率、网站收录论文数和下载量、期刊入网的完整性及期刊编委的国际化程度、开放存取等指标进行统计分析,经过严格评审，排名前10%的在线期刊被评为2015年度“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖。