课题组长简介

熊旭深 博士，浙江大学医学中心、良渚实验室“百人计划”研究员，博士生导师。

熊旭深2014年本科毕业于华中科技大学生物信息学专业；2019年博士毕业于北京大学生命科学学院伊成器教授课题组；2019年起以联合博士后身份在麻省理工计算机与人工智能系 Manolis Kellis 教授 (Head, MIT Computational Biology group) 及哈佛医学院 Richard Gregory 教授课题组进行计算生物学及疾病表观遗传学方向的研究。2022年底，熊旭深博士加入浙江大学医学中心/良渚实验室，成立独立课题组。

熊旭深博士长期从事以计算生物学和实验生物学手段相结合（“干湿结合”）的方式进行遗传疾病的多组学调控机制研究，以第一作者或者共同第一作者发表Nature Genetics, Molecular Cell, Nature Chemical Biology等多篇高水平文章。Google Scholar 引用超过1500次，H-index=11，获2019年“吴瑞奖学金”。

熊旭深博士参与发现了mRNA上m1A新型甲基化修饰，为表观转录组在癌症的研究开辟了新的方向 (Nat Cell Biol. 2016, Mol Cell. 2017, Nat Comm. 2021)，其关于m6A (Nat Genet., 2021) 及 H3K27ac (Nat Genet., In Revision) 的遗传学调控的研究为解析遗传疾病的遗传学位点提供了新的思路和不同层次 ，其关于阿尔兹海默症的遗传致病位点定位及调控解析为寻找可转化的靶位点提供了重要的分子基础 (Cell, In Revision)。

课题组研究方向

本课题组致力于利用计算生物学、人工智能、实验生物学等多学科交叉的手段进行人类遗传疾病的跨层次多组学（epigenomics, RNA modification, transcriptomics, etc）机制研究。具体包括以下3个方向：

1. 基于生物信息学和遗传统计学的多基因遗传疾病（心血管、脑部遗传疾病等）的多组学（表观基因组、RNA修饰组、转录组、翻译组等）整合分析及因果推断；

2. 基于机器学习（主要是深度学习）的表观基因组和表观转录组的预测及关键调控序列及遗传位点的鉴定；

3. 基于Organoid，iPSC，动物模型等体外体系及Perturb-seq, CRISPR screening等高通量实验手段的调控通量机制研究及验证。

一、岗位要求

（一）博士后

1、计算生物学、遗传统计学、人工智能方向（数名）

a)近期（或即将）取得生物信息、计算机、数学、统计、物理、数据科学等相关领域的博士学位（无优先顺序）；

b) 具备扎实的编程能力，具有概率统计、基因组学、深度学习方面知识；

c) 以第一作者（含共同）发表过SCI论文，有一定的独立工作能力；

d) 对生物信息学或人工智能在基因组学中的应用有研究兴趣，有责任心与团队合作精神；

e) 拥有较为良好的英语沟通和写作能力。

2、实验生物学方向（数名）

a) 近期（或即将）取得细胞生物学、生物化学与分子生物学等相关领域的博士学位；

b) 具有扎实的细胞培养、文库构建、生物分子等相关实验技能；

c) 以第一作者（含共同）发表过SCI论文，有一定的独立工作能力；

d) 对以干湿结合的方式进行遗传学机制研究有兴趣，有责任心与团队合作精神；

e) 拥有较为良好的英语沟通和写作能力；

f) 具有Organoid，iPSC等体外体系建立，及Perturb-seq, CRISPR screening, 单细胞建库等高通量实验相关经验者优先。

（二）科研助理/技术员

1、生物信息学、统计遗传学方向（1-2名）

a) 近期（或即将）取得生物信息、计算机、数学、统计、物理、数据科学等相关领域的本科或硕士学历（无优先顺序）；

b) 具有一定的编程能力，具有数理统计或测序数据分析基础；

c) 对生物信息学或基因组学有研究兴趣，有责任心与团队合作精神；

d) 发表过SCI论文的优先。

2、实验生物学方向（1-2名）

a) 近期（或即将）取得生命科学、医学等相关领域的本科或硕士学历；

b) 具有细胞培养、文库构建、生物分子等相关实验技能；

c) 对以干湿结合的方式进行遗传学机制研究有兴趣，有责任心与团队合作精神；

d) 发表过SCI论文的优先。

（三）博士研究生

1、 具有推免资格或符合浙江大学医学院“申请审核”制博士研究生招考要求;

2、 对科学研究充满热情，对未知领域勇于探索，善于发现问题和解决问题；

3、 接受过系统的科研训练，具有严谨的科学态度；

4、 具有出色的英文读写和沟通能力；

5、 善于沟通交流，有良好的责任心和团队协作精神。

二、薪酬待遇

（一）博士后

1、按照本单位博士后管理规定，提供专业的科研指导和具有竞争力的待遇年薪23万+，优秀者一人一议；

2、 支持申报博士后科学基金以及其他国家与地方科研项目；

3、课题组与麻省理工、哈佛医学院等研究机构有合作联系，表现优异者有机会申请国际交流或推荐联合培养；

4、提供一流的科学研究条件和指导，及参加国内外高水平学术会议的机会 ；          

5、 课题组提供积极的工作环境与灵活的工作制度，为成员的职业规划和发展提供最大可能的指导和帮助，博士后出站优秀者有机会申报良渚实验室特聘研究员或副研究员，入职杭州工作者可获得政府资助的安家费及各种人才补贴。

（二）科研助理

课题组提供积极的工作环境与灵活的工作制度，为成员的职业规划和发展提供最大可能的指导和帮助，薪资待遇视具体情况，一事一议。

三、招聘程序

请有意者请将以下材料电子版发送到电子邮箱：xiongxs@mit.edu和xiongxushen1992@gmail.com。详细的个人简历（包括学习工作经历、主要研究工作内容、代表性论文论著清单、获奖情况）及申请人认为其他有借鉴意义的材料。邮件标题请注明“姓名_申请博士后/科研助理/研究生 ”。对于符合要求并通过初审者，将会通知安排面试。应聘材料将予以保密。 

应聘时请将简历抄送一份到：chinayanjiusheng@126.com，邮件标题：应聘单位名称、姓名、学历、专业、博士研究生招聘网